行政事业单位内部控制贯穿单位经济活动的决策、执行和监督全过程，涵盖单位的相关业务和事项，实现对经济活动的全面管控。单位层面内部控制审计，包括建立内部控制建设情况、单位主要负责人承担内控责任的情况、对权力运行的制约情况、内部控制制度完备情况、不相容岗位和职责分离控制情况、内部控制信息化覆盖情况等等。

建立内部控制建设情况，需要重点关注：单位应该成立内部控制领导小组，由单位的主要负责人担任组长，正常开展日常工作，并需明确内部控制的牵头部门，各部门在内部控制中需联动。定期针对国家的相关政策、制度进行培训。结合单位的内部控制目标和业务特点，开展内控风险评估，开展业务流程的梳理。单位主要负责人承担内控责任的情况，需要重点关注：单位主要负责人应主持制定内部控制工作方案，定期召开专题会议，对内部控制建立与实施过程中涉及到的部门和人员进行统一的协调。对权力运行的制约情况，需要重点关注：完成对本单位权力结构的梳理和构建，确保决策权、执行权、监督权，相互制约，相互协调，并定期督查决策权、执行权等权力行驶情况，发现问题，予以纠正。

内部控制制度完备情况，需要重点关注：建立预算管理制度、收入管理制度、支出管理制度、政府采购制度、资产管理制度、建设项目管理制度、合同管理制度、决策制度等。不相容岗位和职责分离控制情况，需要重点关注：通过岗位规章制度和岗位职责手册，对不相容的岗位进行了设计、分离、实施。

内部控制信息化覆盖情况，需要重点关注：内部控制的信息系统应包含预算管理、收支管理、政府采购管理、资产管理、项目管理、合同管理等方面业务。

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收支管理情况，需要重点关注：收入实行归口管理和票据控制；支出实行归口管理和分类控制；举债实行集体决策，定期对账。

政府采购管理情况，需要重点关注：本单位采购的货物、服务、工程应该严格按照政府采购规定执行，积极落实采购政策。

资产管理情况，需要重点关注：对资产定期核查盘点、跟踪管理；按照法定程序和权限，使用和处置资产。

项目管理情况，需要重点关注：按照概算投资，严格履行审核审批程序，建立有效的招投标控制机制，按规定保存建设项目相关档案并及时办理移交手续。

合同管理情况，需要重点关注：对合同文本进行严格审核，并由合同归口管理部门统一管理；加强合同履行的控制。